本院「資訊科技創新研究中心」於民國96年2月設立，旨在統合現於本院資訊科學研究所、計算中心、以及相關所處進行的各項資訊技術的發展及應用的工作，並進一步推展本院的各項跨領域的研發工作。藉由「資訊科技創新研究中心」的成立，以及更合宜的人事晉用、升遷及成效考核制度，可讓參與的技術研發與服務人員，在專業的訓練與工作上，更有所依循，以利技術傳承。「資訊科技創新研究中心」的設立，以其多領域的專家與人力規模，將可協助政府及社會發展前瞻性的資訊技術與策略。

「資訊科技創新研究中心」的任務在於促使資訊科技的服務創新及使用，著重於關鍵性的資訊通訊基礎建設的建置，以及跨領域的科技整合，以求對現今知識經濟及服務經濟體系裡的經濟發展與社會進步，有進一步提升的作用，同時也致力跨領域的創意發展，為人力資源儲備能量，維繫並提升我國總體的國際競爭力。「資訊科技創新研究中心」所提供資訊技術的專業人力資源，將有助於本院以及其他機構的研究者，將研究結果進一步轉化為知識應用的創新系統雛形，並進行系統雛形的推廣、使用與評估以及進一步的技術移轉至新應用。面對全球化和知識經濟時代來臨的挑戰，在發展創新科技服務業的遠景上，以上的工作是日漸重要的；而很多資訊技術上的新想法或突破，也來自發展與使用跨領域系統的經驗。經由進行這些工作，「資訊科技創新研究中心」可具體地善用具資通訊領域之專業知識及研發創意協助業界，促成業學界合作，進而帶動研發價值之提昇。